恐らく、Excelから出力をされておりますでしょうか？Shopify側ではなく、CSVを作成する側のソフトウェアの問題かと思います。
親和性が良く無料なので、一度Google SpreadSheet をお試しいただくと良いかと思います。(Excelからインポートも可能です）
株式会社フルバランス（Shopify Experts）
東京・高田馬場 18期目のWebデザイン・システム制作会社です。Shopify / Shopify Plusの制作・運営をサポートしております。
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