En el panel de administración, configuración, impuestos, puedes validar si deseas mostrar los precios con los impuestos incluidos. la función es "Todos los precios incluyen impuesto.
Los impuestos que se cobran sobre las tarifas de envío están incluidos en el precio del envío."
Además, en el producto, indicas si el producto lleva impuesto o no con la función "Cobrar impuesto sobre la venta de este producto".
La combinación de ambos, hará que se vea tu precio neto y se desglose en la zona de pago.
checa la información oficial: https://help.shopify.com/es/manual/taxes/general-steps
Saludos