Der Schnipsel an sich dürfte schon gelöscht sein. Deswegen erhältst du ja die Fehlermeldung, weil der Schnipsel aus deinem Theme aufgerufen wird, aber nicht mehr da ist. Je nachdem wie stark die App deinen Theme verändert hat, würde ich vorher ein Backup machen, bevor du die Aufrufe für "webyze-swatches" aus deiner theme-datei entfernst.
Nachdem du das aktuelle Theme gesichert hast, könntest du einfach mal im Code-Editor deine liquid Dateien nach Aufrufen von "webyze-swatches" sichten, prüfen und löschen.
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