Olá, @montezza-joias .
Você pode certamente usar o checkout transparente do PagarMe na sua loja Shopify, pois é um dos provedores de pagamento compatíveis no Brasil. Entendi que você também pretende incentivar os clientes pagarem com Pix e oferecer um desconto se utilizam essa forma de pagamento para efetuar a compra no seu site. Você chegou a verificar com o PagarMe se possui esse recurso? Como alternativa, notei que o PagBrasil oferece a opção de desconto no PIX que pode te interessar**.** Vale a pena conferir ambas opcoes para ver qual atenderia melhor às necessidades da sua empresa. Para saber mais sobre como funciona, entre em contato com o suporte do PagBrasil aqui.
Espero que isso ajude!