Si es posible, en Shopify básicamente tienes 3 alternativas de entrega: Envio, Entrega local y recoger en tienda. Cada una la puedes activar o desactivar para toda tu tienda. Por excepciones puedes indicar que un producto se envíe a nivel nacional o que esté excluido y tenga la entrega local y recoger en tienda.
Estos ajustes los haces en la configuración de tu tienda, en la zona de envíos.
Saludos