Olá, @conceitofacil
Acessei sua loja e, após navegar por algumas páginas, notei que realmente o favicon não está aparecendo. Isso pode estar relacionado a algum problema com o tema que está sendo usado, o qual pode estar impedindo a exibição do favicon. Esse problema começou após a instalação de algum app específico ou alguma alteração no código? Você já tentou trocar o tema para verificar se isso resolve a questão?
Para verificar se o problema está relacionado ao seu tema atual, sugiro realizar um teste com um tema diferente.
- Vá em Loja Virtual > Temas > em Temas gratuitos populares clique para adicionar um novo tema**.**
- Ao adicionar um tema ele aparecerá em Biblioteca de temas; na lista de temas não publicados. Clique em Personalizar para acessar o editor de temas.
- Em Configurações do Temas > clique em Logo > Imagem de Favicon > Selecionar imagem > Salvar
- Depois, no topo da página clique nos três pontinhos > Pré-Visualizar
- Acesse as páginas para conferir se o favicon aparece neste novo tema.
Se no novo tema a imagem de favicon aparecer corretamente, tudo indica que o seu tema ativo da loja está com problemas. Neste caso, precisará dar uma olhada no código para entender o que aconteceu e arrumar isso.
Caso esteja usando um tema de terceiros, tente falar com o suporte do tema para buscar assistência. Uma alternativa, seria carregar o tema novamente na sua versão original ou buscar por um novo tema. Você pode adicionar vários temas à sua conta para experimentar novos temas e depois, basta publicar o tema escolhido como o tema atual da sua loja.
Se tiver alguma dúvida, deixe um comentário e ficarei feliz em ajudar.