Hola Matias, excelente pregunta.
Shopify es una plataforma que cumple con los requisitos PCI que significa que protegemos los datos de tarjeta de nuestros usuarios. Si la tienda esta alojada en Shopify, tu información de tarjeta esta segura.
Si necesitas más seguimiento, no dudes en mandarnos un correo con el enlace que mandé en mi ultima respuesta.
Quedamos atento,