Du kannst die Auszahlungen hier anzeigen lassen:
Einstellungen > Zahlungen > Auszahlungen anzeigen (neben deinen Auszahlungskonto) > oben rechts Exportieren.
Hier kannst du dies als CSV downloaden, nicht als PDF. Diese Einstellung gibt es nämlich nicht. Jedes Buchhaltungstool kann CSV - Dateien einlesen. Wenn du dies zum StB gibst, kann er dies spätestens einlesen. Ansonsten, wie @Ben310 schon schrieb, nutze z.B. Pathway, wenn du unbedingt die “pdf” haben möchtest.
Normalerweise ist das so, dass du in deiner Buchhaltungssoftware die Rechnungen erstellst. Nachdem du in dem Abrechnungszeitraum die Auszahlung bekommen hast, holst du dir die Gebühren via CSV raus und buchst die einfach gegen. Dazu hatte Eshop Guide ein Video erstellt, auf Basis von Lexoffice: https://www.youtube.com/watch?v=JmvObuqfdbQ
Ist natürlich auch auf andere Lösungen anwendbar. Sieht dann nur anders aus. 