貼っていただいたGraphQLクエリで、
Postmanからカスタムアプリを介して、
メタフィールドの日付リストの更新を行ってみたところ、
問題なく、日付リストを更新できましたので、
質問者様がおっしゃるように、
リクエストの整形に問題があるのかもしれません。
少し気になった点として、
//newTimeListの出力結果
"2022-09-29T02:30:00Z\",\"2022-10-05T05:40:19.145Z\"
こちらに、先頭のバックスラッシュがないようです。
雑ですが、こちらを、
const newTimeList = newArray.join(",\\");
下記のようにされてはいかがでしょうか？
const newTimeList = "\\" + newArray.join(",\\");
ご参考まで。
(キュー田辺)