Boa tarde @Barros ,
Pelo que entendi, você tentou vincular o domínio que você comprou do HostGator a sua loja Shopify e recebeu uma mensagem de erro indicando que já existe um site com esse nome de domínio loja - correto? Como um domínio normalmente é registado anualmente, se o dono anterior do domínio montou uma loja e desistiu da mesma sem desvincular o domínio da conta, então por isso você esta recebendo essa mensagem. Isso não seja um problema como você é o novo dono do domínio. Para liberar o domínio para uso na sua loja, entre em contato com a nossa equipe de atendimento aqui e inclui na sua mensagem uma imagem do painel do seu domínio exibindo as seguintes informações;
Espero que isso ajude! Nos avise se você tiver qualquer outra dúvida.
Até mais,