Oi @importsflow ,
Você está usando algum aplicativo para integrar os produtos de sua loja com seus fornecedores? Caso esteja usando um aplicativo como Oberlo em sua loja, é possível que o app esteja atualizando os preços para refletir alterações que o fornecedor tenha feito no custo do produto.
Se você puder nos contar mais sobre o que você está notando em sua loja, com exemplos de produtos e capturas de telas, poderemos entender melhor sua questão e te orientar melhor sobre como resolver esse problema.
Ser você estiver usando o aplicativo Oberlo, confira esse post de nossa Comunidade onde explicamos o motivo dessa alteração e como evitar que os preços continuem a mudar em sua loja:
Ficamos no aguardo de mais detalhes 
Até mais! | Luisa