なるほど。あとは、brew でインストールしている場合、CLIとngrok を以下の手順で削除して、もう一度入れ直すぐらいですかね・・ （ngrokは、CLIのインストール時に入るはずです）
https://macgarage.jp/homebrew-uninstall/
brew uninstall shopify-cli
brew uninstall ngrok
CLIのGitHubでは、brewの手順が記載してあるので、brew でやるのをお勧めします。
https://github.com/Shopify/shopify-cli
もし、別のPCがあれば、それで試して、同じストアやテーマに対してうまくいけば、環境依存ということになります。
なお、MacのOSは新しいものでしょうか？