注文に含む特定SKUの購入数を識別したい

添付画像の状態であれば、Quantityは注文内の商品点数の総数になると思いますので対応できないと思います。

多少興味があり試作したところ以下のような形であれば動作するかなと思います。

参考:

https://help.shopify.com/ja/manual/shopify-flow/advanced-workflows#loops

以上ですが動作しなかったり趣旨が違う場合は申し訳ありません。