Olá @Jeanderson ,
Essa mensagem não é nada de se preocupar, e não irá afetar a sua loja. Tudo o que isto significa é que o seu tema atual não suporta o recurso de filtragem. Só para confirmar, a mensagem de erro é a seguinte;
A mensagem de erro que notou aparece-lhe apenas na seção de Coleções e Filtros ao navegar para Loja Virtual > Navegação dentro do painel da sua sua loja e os seus clientes não verão esta mensagem porque e interna. Ainda pode criar filtros para a sua loja, mas eles não são exibidos na sua loja online, a menos que o seu tema suporte a funcionalidade.
Teve oportunidade de verificar alguma das aplicações ou temas que eu sugeri acima que incluem a funcionalidade de filtragem?