送料の設定について

配送料の条件が、１つしか登録できないので、標準機能だとできません。

（2kgまで、かつ、購入金額が10,000円未満という条件ができれば可能なのでしょうが）。

やるとすると、アプリによる配送料計算を独自に実装することになると思います。
https://shopify.dev/docs/admin-api/rest/reference/shipping-and-fulfillment/carrierservice?api[version]=2020-04