東京都内の23区とそれ以外で送料を変更する方法はありますか？
23区内は直接お届け（送料無料）、23区外は配送業者による配送（送料あり）の設定にしたいです。
ご質問いただいている東京23区内のみ送料無料にしたい件ですが、Shopify標準機能（ローカルデリバリー）での対応または、アプリを使っての対応が考えられます。
今回は無料で利用可能な、Shopify標準機能（ローカルデリバリー）についてご説明させていただきます。
設定方法1. 管理画面左下の設定をクリック
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配送と配達をクリック
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ローカルデリバリーのShop locationをクリック
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『このロケーションではローカルデリバリーを提供しています』のチェックボックスにチェックを入れる
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配送エリアの『郵便番号を使用する』にチェック
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エリア名のにわかりやすい名称を入力
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郵便番号に23区の郵便番号を入力（先頭3桁の後ろはアスタリスク（*）で省略可能）
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最低注文価格を入力
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保存をクリック
上記設定を行うとチェックアウト画面で下記の画像のように、送料は初期状態でローカルデリバリー（無料）が選択された状態で表示されます。
ご参考まで。
(キュー小坂)