@shopify/cli": "^3.48.3"
CLIを3.48.3にアップグレードしたところ、下記のメッセージが表示される事象については解消しておりました。
>また、「npm run dev」コマンドを実行した際も下記のメッセージが表示されるため、
>「To preview your extensions, make sure that development store preview is enabled in the Partner >Dashboard」
しかし、そのほかの問題についてはまだ解決しておりません。