コンビニ決済の未入金キャンセル対応について

管理画面のどの部分を見ているかによりますが、

Shopifyでは注文時(※配送タイミングではない)に売上として上げている画面があるため、キャンセルをするとその数字から引かれます。

この処理自体は実際の入金とは別なので問題ないかと存じます。

(むしろそこから引かれないと実数値と合わなくなり不都合が出てくるかと思います。)