質問拝見しました。
ストア全体を表示しないようにするのであれば、theme.liquidのファイルのタグ内に以下コードを埋めてください
<meta name="**robots**" content="noindex">
詳しいやり方については下記参考サイトを添付いたしますので順従ってにやっていただければと思います！
ご参考までにしてください！
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株式会社フルバランス