配送方法設定で日本のヤマト宅急便は使えませんか？
ストア設定画面からの配送業者アカウントの連携については、まだ日本の運送会社を指定はできません。 参照
現状は別途送り状なども生成できるアプリ（Ship&coなど）を活用して利用しているストアがほとんどかと思います。
ご参考になりますと幸いです。