カスタムフォームで入力された内容をメールテンプレートに引き継ぐ

https://shopify.dev/docs/themes/liquid/reference/objects/line_item#line_item-properties

https://help.shopify.com/ja/manual/orders/notifications/email-variables#part-deed74d294eccc84

あまり内容を理解できていませんが、恐らく上記のヘルプにある「line_item.properties」や「line_item」が該当すると思います。

なお、こういったことはあまり書くべきではないとは思いますが、失礼ながら参考されたサイトは技術系の方が書いているわけではないようですので、以下のような技術系の方が作成された記事を参考にされることをお勧めします。

https://www.shopify.jp/blog/partner-shopify-theme-customize-cart-attributes-line-item-property-customer-note

https://haniwaman.com/shopify-product-option/

https://w3trends.zendesk.com/hc/en-us/articles/115001808432-Edit-your-Confirmation-Email-to-include-Product-Options-

また、記載されている内容がわからないということになりましたら、あくまで個人的な見解ではありますが、さらに学ばれるか、業者に依頼されることをお勧めします。
もちろんアプリを使うのも良いかと思います。

[追記]

フォーラムの検索をお勧めするのを書き忘れていましたので追記します。

https://community.shopify.com/c/forums/searchpage/tab/message?q=line_item