サイトを拝見すると、すでに解決されているようですね。https://eenieofficial.jp/products/%E3%83%AD%E3%83%B3%E3%82%B0%E3%82%B9%E3%83%AA%E3%83%BC%E3%83%96%E3%83%AB%E3%83%BC%E3%82%BA%E3%83%8B%E3%83%83%E3%83%88%E3%83%88%E3%83%83%E3%83%97%E3%82%B9-1
原因も特定済みかもしれませんが、
私も同様の現象に出会ったことがあるので、
ご共有まで。
以前、
sectionsのliquid(sections/main-product.liquidなど)で使用できる {% stylesheet %} 内のCSSだけ編集して保存した際に、
その変更が反映されないことがありました。
https://shopify.dev/themes/architecture/sections/section-assets#stylesheet
当該liquid内の、
{% stylesheet %}以外の別の箇所に改行を入れるなどの変更を施し保存すると、
CSSの変更も反映された覚えがあります。
記憶が曖昧な部分があり不確かな情報ですが、
ご共有まで。
(キュー田辺)