Ich kenne dein Theme jetzt nicht direkt, daher kann ich nichts zur Ordnerstruktur sagen. Im Normalfall wirst du irgendwo eine Datei namens theme.css o.ä. finden. Da kannst du auch deinen “alten” Custom CSS reinkopieren. Das würde ich an deiner Stelle allerdings erst tun, wenn du dich mit deinem Theme etwas intensiver auseinandergesetzt hast. Wenn du Klassen deines alten Themes überschrieben hast, die im neuen Theme gar nicht genutzt werden, kann es sein, dass du dir das Layout zerschießt