Shopify API連携を行う際のセキュリティやログ監視

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分析を目的に、Shopify のAPIを外部へと連携しようと考えております。

API連携はどうしてもセキュリティ的に弱くなってしまうと思うのですが、
何か皆さんが行っているセキュリティ対策などはございますでしょうか？

もしご教授いただけましたら参考にさせていただきたいです。