Shopify のサブスクリプションAPIがリリースされる前は、BOLD のアプリは外部決済で実現していましたが、現在（V2）は、サブスクリプション APIがサポートする決済（現在は、Shopify Paymentのみ）のみ利用可能です。
https://shopify.dev/concepts/apps/subscription-apps
代引きはサポートされていませんし、そもそも商品をサブスク対象にした時点で、Shopify Payment以外決済で選べなくなるので、何か設定か仕様の思い間違いをされているのではと思います。
ちなみに以下のような日本のパートナーが提供しているアプリもあるので、もしBOLDが合わない場合は、別のものを試されるのも良いかと思います。