アプリをアンインストールした後、コードが残る場合があると思うのですが、それはどこのファイルから消去することが可能ですか？
All in giftのアプリになります。
はじめまして
株式会社Tsunの吉谷と申します。
All in giftアプリのヘルプページを確認したところ、Vintageテーマ（Online Store 2.0以外のテーマ）のみアプリ導入時に、コードを挿入する作業が必要みたいです。
そのため、ご利用中のShopifyテーマがOnline Store 2.0テーマであれば、コードは残らないと思いますし、Vintageテーマであれば、アプリを導入した担当者がコードを挿入しているはずなので、その担当者に確認されるのが早いと思います。
参考ページ
はじめにアプリの初期設定をしてください｜All in giftアプリ
不安であれば、All in giftアプリのサポートに問い合わせるのも良いと思います。（上記の参考ページに問い合わせ先が書いてありました）
以上になります。
ご参考になりましたら幸いです。