お名前.comでとったドメイン、サーバーはAWSでメールを使用しています（このドメインでショップサーブで制作したECを運営中）。
今回Shopifyへのカート乗り換えを行い、既存ドメイン接続の方法でShopifyにドメインを紐づけるのですが、メールの設定は何か変わりますでしょうか。
ドメイン及びサーバーに変更がないので、メールアドレスに関する移行等作業は何も発生しないという認識であっておりますでしょうか。
DNSの設定状況によるので、確信を持った回答はできないのですが、おそらく、メールアドレスに関する情報の設定変更は不要ではないかと思います。
https://help.shopify.com/ja/manual/domains/add-a-domain/connecting-domains/connect-domain-manual
上記ページに記載の通り、
Shopifyで独自ドメインを使用するには、
指定の、AレコードとCNAMEレコードをDNSに設定することになりますが、
それらの設定がメールサーバの設定に干渉するとは考えにくいためです。
強いていうなら、
こちらに記載のようにDKIMとSPFレコードをDNSに追加することがあるかもしれません。
DKIMは問題になりにくいと思いますが、SPFレコードがすでに存在する場合、多少の工夫が必要になるかもしれません。
ご参考まで。
(キュー田辺)