「有料プランへ変更」とは、具体的に所有権の移行手続きを進めたということでしょうか？
下記URLの「開発ストアの所有権を移行する」の手順４にもあるように「クライアントが移行を承諾するまで一時停止されます。」
お客様の方で所有権の移行を承諾する手続きがされているかご確認ください。
また、有料アプリのテストについて、正しいやり方かどうかわかりませんが、私のやり方をご紹介します。
※ケースバイケースの対応が必要になろうかと思いますので、ひとつの参考としてお考え下さい。
１．「shopify partner friendly apps」か確認する。
２．そうでなければ「shopify partner friendly apps」にならないか、サポートに相談する。
３．サポートから良い返事がなかった場合、お客様に本番環境でのテストを相談する。
私は以前まで自腹を切ってテストしていましたが、制作会社の方にご相談した際に、お客様にご相談して費用を負担して頂くことが多いと教えて頂きました。
その方がお客様もストア構築を進めようと積極的に関与してもらえるということです。
よろしくお願いします。