無料体験中、プランも設定し、使用していましたが、３日後からアカウントが非アクティブと表示され制限がかけられているとなっています。ヘルプセンターでも管理画面での設定を完了しているはずなのに、次にすすめません。メールもオンラインでのお客様の支払い完了は届いていましたが、そのあとアカウントが使えないと届きました。支払いの設定もしていて、注文されている商品もあるのに使えないのはなぜですか？
本件はShopifyの話でしょうか？それとも、Shopofyアプリの話でしょうか？
Shopifyの話であれば、Shopifyサポートへ問い合わせるのが良いかと思います。
また、Shopifyアプリの話であれば、アプリベンダーに問い合わせると良いかと思います。（Shopifyアプリストアの該当アプリページにアクセスし、「サポートに連絡する」から問い合わせできます。）
以上になります。
参考になりましたら幸いです。